Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRIF1Q5T3J3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIF1Q5T3J3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms