Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR44Q5JSH3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR44Q5JSH3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms