Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF394Q53GI3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF394Q53GI3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms