Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP13A4Q4VNC1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms