Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRNQ4KMQ1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRNQ4KMQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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