Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP221Q4G0U5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms