Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LSM12Q3MHD2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LSM12Q3MHD2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms