Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTL8BQ17RB0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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