Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM187BQ17R55 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms