Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R3AQ16821 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPP1R3AQ16821 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms