Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDB1Q16531 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDB1Q16531 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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