Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIK5Q16478 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIK5Q16478 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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