Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS72Q15906 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms