Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKBIBQ15653 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKBIBQ15653 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms