Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKD1Q15139 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKD1Q15139 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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