Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPHQ15003 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPHQ15003 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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