Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHPRHQ149N8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SHPRHQ149N8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
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