Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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UBE4AQ14139 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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UBE4AQ14139 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4AQ14139 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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UBE4AQ14139 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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UBE4AQ14139 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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UBE4AQ14139 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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UBE4AQ14139 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE4AQ14139 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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