Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
COL9A2Q14055 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COL9A2Q14055 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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