Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBFBQ13951 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms