Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SHROOM2Q13796 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHROOM2Q13796 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
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