Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXE3Q13461 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms