Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
MAP3K1Q13233 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MAP3K1Q13233 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms