Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAPQ12770 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAPQ12770 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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