Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ARE2YNR019W 1929 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RTC5YOR118W 1704 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SUP35YDR172W 2058 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 NTE1YML059C 5040 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 VMA13YPR036W 1437 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SOF1YLL011W 1470 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YRA2YKL214C 612 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YLR296WYLR296W 327 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 SPG4YMR107W 348 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 EOS1YNL080C 1101 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 PCS60YBR222C 1632 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RRN3YKL125W 1884 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 SMF2YHR050W 1650 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RVB1YDR190C 1392 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MID1YNL291C 1647 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RPS16BYDL083C 432 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 ERV1YGR029W 570 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YHI9YHR029C 885 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 BCY1YIL033C 1251 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 REE1YJL217W 597 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YKL107WYKL107W 930 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 ECM4YKR076W 1113 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 ERI1YPL096C-A 207 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 IRC16YPR038W 360 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YBP2YGL060W 1926 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 AMD2YDR242W 1650 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 ENT2YLR206W 1842 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 ARP5YNL059C 2268 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 SIF2YBR103W 1608 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RMR1YGL250W 726 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MPC3YGR243W 441 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 DJP1YIR004W 1299 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YJR038CYJR038C 363 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 AAR2YBL074C 1068 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YNL184CYNL184C 327 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 CAM1YPL048W 1248 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 DER1YBR201W 636 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YML096WYML096W 1578 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MSM1YGR171C 1728 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 NOP2YNL061W 1857 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 LEU1YGL009C 2340 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YTA12YMR089C 2478 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 SSF2YDR312W 1362 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MAK5YBR142W 2322 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YVC1YOR087W 2028 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 SEC27YGL137W 2670 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 CNL1YDR357C 369 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YER137W-AYER137W-A 306 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 LYS1YIR034C 1122 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YOR121CYOR121C 306 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 HES1YOR237W 1305 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 HOM3YER052C 1584 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MSS4YDR208W 2340 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YDR154CYDR154C 351 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RMT2YDR465C 1239 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 VMA10YHR039C-A 345 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RPS1BYML063W 768 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 NOP15YNL110C 663 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 NUD1YOR373W 2556 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 PDC1YLR044C 1692 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 TEA1YOR337W 2280 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RAD3YER171W 2337 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MNN2YBR015C 1794 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MTL1YGR023W 1656 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 TRP5YGL026C 2124 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 CRG1YHR209W 876 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MRPL20YKR085C 588 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 MBF1YOR298C-A 456 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YBR032WYBR032W 303 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YPR039WYPR039W 336 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 KKQ8YKL168C 2175 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 FRS2YFL022C 1512 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RAD24YER173W 1980 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 OSH6YKR003W 1347 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 DHR2YKL078W 2208 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 RPN3YER021W 1572 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 IMD2YHR216W 1572 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 FUS2YMR232W 2034 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 DBF4YDR052C 2115 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 GNT1YOR320C 1476 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1A-DR3Q12441 YDR053WYDR053W 396 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 API2YDR525W 330 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 PIR1YKL164C 1026 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1A-DR3Q12441 LDB18YLL049W 540 nt5.15□□□□□ -1.59
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