Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 BET1YIL004C 429 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 SYS1YJL004C 612 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YKL131WYKL131W 522 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YLR122CYLR122C 378 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 RRG8YPR116W 834 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 RPO21YDL140C 5202 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 OPT2YPR194C 2634 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 TAF12YDR145W 1620 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 SBE22YHR103W 2559 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YGL159WYGL159W 1113 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 YBL065WYBL065W 345 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 KHA1YJL094C 2622 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 KAR5YMR065W 1515 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 SPO1YNL012W 1896 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 snR17asnR17a 333 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 MYO4YAL029C 4416 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 SEG1YMR086W 2883 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1B-GR3Q12316 UNG1YML021C 1080 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 BUD4YJR092W 4344 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 TAF6YGL112C 1551 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 Q0010Q0010 387 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 OAF3YKR064W 2592 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 PDS1YDR113C 1122 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 CIR1YGR207C 786 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 SWC7YLR385C 399 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 FYV12YOR183W 390 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 HST2YPL015C 1074 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 REB1YBR049C 2433 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 HUG1YML058W-A 207 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 AMS1YGL156W 3252 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 TOR1YJR066W 7413 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 RPL25YOL127W 429 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 ADR1YDR216W 3972 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YSP2YDR326C 4317 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 BUD2YKL092C 3315 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 ECM5YMR176W 4236 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YAR009CYAR009C 3591 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YHL045WYHL045W 348 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YHR210CYHR210C 1026 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 RSM19YNR037C 276 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 RFC5YBR087W 1065 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 PEP7YDR323C 1548 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YBR139WYBR139W 1527 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 SEF1YBL066C 3447 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 APN2YBL019W 1563 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-GR3Q12316 TRM3YDL112W 4311 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 VPS27YNR006W 1869 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ARP7YPR034W 1434 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 PRP8YHR165C 7242 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 WHI4YDL224C 1950 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 COS111YBR203W 2775 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 BNA4YBL098W 1383 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 RCY1YJL204C 2523 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 HRD3YLR207W 2502 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 SAT4YCR008W 1812 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 YHR177WYHR177W 1362 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 BPT1YLL015W 4680 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 HRD1YOL013C 1656 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 YER133W-AYER133W-A 342 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ATG19YOL082W 1248 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 SKM1YOL113W 1968 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 NIC96YFR002W 2520 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 NUP192YJL039C 5052 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ISM1YPL040C 3009 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 SEY1YOR165W 2331 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 NVJ1YHR195W 966 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 BNI4YNL233W 2679 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 FAS1YKL182W 6156 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ELP3YPL086C 1674 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 LIF1YGL090W 1266 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ALG14YBR070C 714 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 KAP95YLR347C 2586 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 FMP10YER182W 735 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 SMA1YPL027W 738 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 GIP1YBR045C 1920 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 ARD1YHR013C 717 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 RPL36AYMR194W 303 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-GR3Q12316 PUT2YHR037W 1728 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 SYM1YLR251W 594 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 UBP6YFR010W 1500 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 PCL8YPL219W 1479 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 SET2YJL168C 2202 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 IRR1YIL026C 3453 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 YDR149CYDR149C 708 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 RPS7AYOR096W 573 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 SEC6YIL068C 2418 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 SQS1YNL224C 2304 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 ARP5YNL059C 2268 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 UTP15YMR093W 1542 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 THO1YER063W 657 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-GR3Q12316 YGR073CYGR073C 372 nt3.07□□□□□ -1.92
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