Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YGL138CYGL138C 1038 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 SDP1YIL113W 630 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YPT7YML001W 627 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YNL181WYNL181W 1224 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 MRP2YPR166C 348 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 RIT1YMR283C 1542 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 SIZ1YDR409W 2715 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YGR064WYGR064W 369 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 GTT1YIR038C 705 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 KAP104YBR017C 2757 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 UBP8YMR223W 1416 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 MYO5YMR109W 3660 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 NDT80YHR124W 1884 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 MSH2YOL090W 2895 nt3.41□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 RPS21AYKR057W 264 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 COQ9YLR201C 783 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YNL184CYNL184C 327 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 GIS2YNL255C 462 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PRM4YPL156C 855 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PKP2YGL059W 1476 nt3.4□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 RDS1YCR106W 2499 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 TIF4631YGR162W 2859 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 HTA1YDR225W 399 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YEL075CYEL075C 369 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PUG1YER185W 912 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 OTU1YFL044C 906 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 DCG1YIR030C 735 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YJR128WYJR128W 360 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PSY3YLR376C 729 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 URA4YLR420W 1095 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YBR053CYBR053C 1077 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 TAF2YCR042C 4224 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 KAR5YMR065W 1515 nt3.39□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 VPS9YML097C 1356 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 VPS3YDR495C 3036 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 ARF1YDL192W 546 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YDR336WYDR336W 945 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 ECM11YDR446W 909 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YEL074WYEL074W 339 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YGR039WYGR039W 312 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 SWD2YKL018W 990 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 RIM11YMR139W 1113 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 HHF2YNL030W 312 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 TUM1YOR251C 915 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PIN3YPR154W 648 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PKH1YDR490C 2301 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YDL176WYDL176W 2127 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 MDV1YJL112W 2145 nt3.38□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 CDH1YGL003C 1701 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YHR097CYHR097C 1101 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 ARC19YKL013C 516 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PHD1YKL043W 1101 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YKR011CYKR011C 1062 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 POL30YBR088C 777 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PHO88YBR106W 567 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 UTP6YDR449C 1323 nt3.37□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 TGL3YMR313C 1929 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 MSD1YPL104W 1977 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 EMP70YLR083C 2004 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 RRN6YBL014C 2685 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 RRP42YDL111C 798 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YHR173CYHR173C 339 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 FLD1YLR404W 858 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YNR062CYNR062C 984 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 IZH4YOL101C 939 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 BUD21YOR078W 645 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 MCT1YOR221C 1083 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 DER1YBR201W 636 nt3.36□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 PET54YGR222W 882 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 SIC1YLR079W 855 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YNL171CYNL171C 369 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 DUG3YNL191W 1074 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 SRC1YML034W 2505 nt3.35□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YAT2YER024W 2772 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 CHA4YLR098C 1947 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 SST2YLR452C 2097 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 AIM25YJR100C 984 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YBL028CYBL028C 321 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 MOH1YBL049W 417 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 SSU72YNL222W 621 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 YOR062CYOR062C 807 nt3.34□□□□□ -1.87
NFI1Q12216 LTV1YKL143W 1392 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 WHI3YNL197C 1986 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SLI1YGR212W 1407 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SLA1YBL007C 3735 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 PTM1YKL039W 1572 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 SPH1YLR313C 1593 nt3.34□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RNH202YDR279W 1053 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 RPS25AYGR027C 327 nt3.33□□□□□ -1.88
NFI1Q12216 YGR114CYGR114C 390 nt3.33□□□□□ -1.88
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