Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1B1Q10567 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms