Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CGNL1Q0VF96 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CGNL1Q0VF96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CGNL1Q0VF96 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms