Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNA1Q09470 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms