Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCBP1Q09161 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCBP1Q09161 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms