Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUDPQ08623 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms