Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDR1Q08345 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms