Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB2Q08289 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB2Q08289 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms