Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LRP1Q07954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms