Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK18Q07002 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms