Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LTBQ06643 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LTBQ06643 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LTBQ06643 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LTBQ06643 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LTBQ06643 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms