Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GABPAQ06546 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPAQ06546 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms