Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPN11Q06124 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN11Q06124 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN11Q06124 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms