Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACVR1Q04771 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACVR1Q04771 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACVR1Q04771 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms