Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YPK3YBR028C 1578 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 FRE8YLR047C 2061 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RPA190YOR341W 4995 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YCL076WYCL076W 744 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 FRQ1YDR373W 573 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YGR018CYGR018C 330 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YIL089WYIL089W 618 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 JIP3YLR331C 378 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RPN13YLR421C 471 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YOR331CYOR331C 558 nt3.39□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 NSP1YJL041W 2472 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 MAL12YGR292W 1755 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 MAL32YBR299W 1755 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 BCH1YMR237W 2175 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 KAP95YLR347C 2586 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CEP3YMR168C 1827 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CPA2YJR109C 3357 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YGR026WYGR026W 837 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CFD1YIL003W 882 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CAB2YIL083C 1098 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CPR8YNR028W 927 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 USV1YPL230W 1176 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YPR136CYPR136C 513 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 HPA2YPR193C 471 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 AEP2YMR282C 1743 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YMR018WYMR018W 1545 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YDR089WYDR089W 2610 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CLG1YGL215W 1359 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 TFC4YGR047C 3078 nt3.38□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 FLO9YAL063C 3969 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YDR491CYDR491C 492 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YGR126WYGR126W 693 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RPC34YNR003C 954 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YOR314WYOR314W 330 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YBR116CYBR116C 528 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 GYP7YDL234C 2241 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YLR446WYLR446W 1302 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YPR148CYPR148C 1308 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RSE1YML049C 4086 nt3.37□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CCM1YGR150C 2595 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 QRI7YDL104C 1224 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YHP1YDR451C 1062 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YGR149WYGR149W 1299 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YGR219WYGR219W 342 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 ATP12YJL180C 978 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 PEX11YOL147C 711 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 DGA1YOR245C 1257 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 PBP2YBR233W 1242 nt3.36□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 SHU2YDR078C 672 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RMD5YDR255C 1266 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 VFA1YER128W 612 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 REX3YLR107W 1215 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 TVP18YMR071C 504 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 OCA2YNL056W 594 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CYC2YOR037W 1101 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 VAM10YOR068C 345 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RFM1YOR279C 933 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 HSH49YOR319W 642 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RPS12YOR369C 432 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 CTM1YHR109W 1758 nt3.35□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 TSC11YER093C 4293 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 SEC59YMR013C 1560 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 HAP4YKL109W 1665 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 ARG2YJL071W 1725 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 ALG8YOR067C 1734 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 BSC2YDR275W 708 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 DUO1YGL061C 744 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 DOG1YHR044C 741 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 RPS11BYBR048W 471 nt3.34□□□□□ -1.87
CSI1Q04368 AYT1YLL063C 1425 nt3.34□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YGR067CYGR067C 2415 nt3.33□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 VAS1YGR094W 3315 nt3.33□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 SIN4YNL236W 2925 nt3.33□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 UAF30YOR295W 687 nt3.33□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 UTP6YDR449C 1323 nt3.33□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 SQS1YNL224C 2304 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YPL150WYPL150W 2706 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 FLO1YAR050W 4614 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RPN1YHR027C 2982 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PHO81YGR233C 3537 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RPS29BYDL061C 171 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 CLB3YDL155W 1284 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YDR431WYDR431W 312 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 DLS1YJL065C 504 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PHD1YKL043W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PCD1YLR151C 1023 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RLP7YNL002C 969 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 ATG3YNR007C 933 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YOR238WYOR238W 912 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 AEP3YPL005W 1821 nt3.32□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PBS2YJL128C 2007 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 ATP25YMR098C 1839 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 MED2YDL005C 1296 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YDL162CYDL162C 357 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 STE14YDR410C 720 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 LIF1YGL090W 1266 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YGL101WYGL101W 648 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RPS22AYJL190C 393 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YJR111CYJR111C 852 nt3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.1 ms