Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	KXD1	YGL079W	657 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	CFD1	YIL003W	882 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ERP1	YAR002C-A	660 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RNH203	YLR154C	333 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TRM112	YNR046W	408 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ALA1	YOR335C	2877 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	SYT1	YPR095C	3681 nt		3.86	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YDL199C	YDL199C	2064 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YDL162C	YDL162C	357 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	BUD26	YDR241W	288 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YGL138C	YGL138C	1038 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TAM41	YGR046W	1158 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	EPT1	YHR123W	1176 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YJR128W	YJR128W	360 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	CSH1	YBR161W	1131 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RRP7	YCL031C	894 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	NTO1	YPR031W	2247 nt		3.85	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TSC13	YDL015C	933 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ARG3	YJL088W	1017 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RSM26	YJR101W	801 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TDA8	YAL064C-A	381 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	RPL8B	YLL045C	771 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	TFB6	YOR352W	1032 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	FIG1	YBR040W	897 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	PET20	YPL159C	762 nt		3.84	□□□□□ -1.79
SYF1	Q04048	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.84	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RAD55	YDR076W	1221 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	BMH2	YDR099W	822 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YIL024C	YIL024C	570 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	HYM1	YKL189W	1200 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YML090W	YML090W	387 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MTG1	YMR097C	1104 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	DUG3	YNL191W	1074 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RDS2	YPL133C	1341 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MON1	YGL124C	1935 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MIP6	YHR015W	1980 nt		3.83	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	REC8	YPR007C	2043 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	TAN1	YGL232W	870 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PRP18	YGR006W	756 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	DOG1	YHR044C	741 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	DCG1	YIR030C	735 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PBA1	YLR199C	831 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	ATG19	YOL082W	1248 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RPS10A	YOR293W	318 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	ICS2	YBR157C	768 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	FYV5	YCL058C	459 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YPP1	YGR198W	2454 nt		3.82	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PMI40	YER003C	1290 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RIF2	YLR453C	1188 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YIP3	YNL044W	531 nt		3.81	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	TFB2	YPL122C	1542 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	STE24	YJR117W	1362 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YDR124W	YDR124W	975 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	GPP2	YER062C	753 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YJR111C	YJR111C	852 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YLR290C	YLR290C	834 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RLP7	YNL002C	969 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PNO1	YOR145C	825 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PIN3	YPR154W	648 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YBR089W	YBR089W	600 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	STP1	YDR463W	1560 nt		3.8	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	HUL5	YGL141W	2733 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	EBS1	YDR206W	2655 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	KAR1	YNL188W	1302 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	SST2	YLR452C	2097 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YDR149C	YDR149C	708 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PFS1	YHR185C	714 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	GLO1	YML004C	981 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	PML39	YML107C	1005 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	RIM9	YMR063W	720 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	AME1	YBR211C	975 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YML096W	YML096W	1578 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	THR4	YCR053W	1545 nt		3.79	□□□□□ -1.8
SYF1	Q04048	MET10	YFR030W	3108 nt		3.79	□□□□□ -1.8

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