Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNB1Q02641 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB1Q02641 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms