Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK16Q00536 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK16Q00536 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms