Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC1P78348 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms