Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBXN2AP68543 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms