Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBA52P62987 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBA52P62987 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBA52P62987 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBA52P62987 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBA52P62987 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms