Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVS71-1P61550 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms