Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LILRA4P59901 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LILRA4P59901 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms