Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP107P57740 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP107P57740 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP107P57740 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms